Offre de stage de Master 2 en chimie des produits naturels – analyses métabolomiques

Isolement de composés d’étoiles de mer à activités modulatrices de kinases

Contexte du projet de recherche

Ce stage de M2 s’inscrit dans le cadre du projet ANR STARSKI (STARfish as a new Source of KInase modulators, 2025-2028) visant à explorer de manière approfondie le potentiel des métabolites de deux étoiles de mer comme source de nouveaux inhibiteurs ou activateurs de kinases dans le domaine de la santé humaine, de la croissance et de la santé animale et végétale.

Missions à réaliser

  • La/le stagiaire participera au profilage métabolique par UHPLC-HRMS/MS des différents fractions et sous-fractions d’étoiles de mer et à leur caractérisation chimique par analyses déréplicatives par couplages LC-HRMS/MS afin d’enrichir les connaissances sur les deux espèces étudiées.
  • Il / elle contribuera également à l’isolement et la purification par les méthodes classiques de chromatographie des molécules détectées comme potentiellement modulatrices de kinases après couplage bioinformatique des données analytiques et biologiques (réalisation de réseaux moléculaires bioactifs).
  • Enfin, la caractérisation structurale des métabolites isolés sera effectuée par interprétation des analyses par spectrométrie de masse haute résolution et RMN 1D et 2D.

Structure d’accueil

  • Institut des Substances et Organismes de la Mer – ISOMer, équipe M3 (Métabolites du Microbiome Marin).
  • Nantes Université, Nantes, France.
  • L’équipe M3 du laboratoire ISOMer conduit des travaux visant à l’identification de métabolites d’organismes marins d’intérêt en écologie chimique et en thérapeutique antimicrobienne et anticancéreuse.
  • Elle a une longue expertise en chimie des produits naturels appliquée principalement aux molécules de microorganismes marins, dont les champignons.
  • L’équipe s’appuie sur sa plateforme Corsaire-ThalassOMICS (BioGenOuest) d’analyses métabolomiques comprenant divers systèmes UHPLC-DAD-MSn, UHPLC-DAD-HRMS/MS et GC-MS et outils bioinformatiques permettant la déréplication automatisée et la comparaison de profils métaboliques.

Période et durée du stage

  • A partir de janvier-février 2025 en fonction de la formation.
  • 5 à 6 mois.

Profil et compétences souhaités

  • Étudiant.e en Master 2 dans les domaines de la Chimie des produits naturels, Chimie analytique ou équivalent.
  • Rigueur, esprit d’initiative et goût pour le travail en laboratoire.
  • Compétences en traitement de données de spectrométrie de masse, en métabolomique et en analyse structurale des substances naturelles.

Candidature