Offre d’emploi : Ingénieur·e d’études en biologie moléculaire (H/F) – Projet CECIL (ANR) – UPVD Perpignan

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Entreprise

L’Université de Perpignan Via Domitia (UPVD) est une université pluridisciplinaire qui favorise l’égalité des chances, avec un fort ancrage territorial en Occitanie Pyrénées-Méditerranée. Elle compte 4 sites à Perpignan et 7 autres dans les Pyrénées-Orientales et l’Aude, ainsi que deux sites délocalisés à Paris et au Maroc.

L’UPVD accueille environ 9 500 étudiants, dont 350 doctorants, et emploie près de 450 enseignants-chercheurs et enseignants, 400 personnels administratifs et techniques, et plus de 600 vacataires. Elle est organisée en 5 facultés et 3 instituts. Avec ses 17 laboratoires, dont beaucoup sont liés à des instituts nationaux comme le CNRS, ses deux fédérations de recherche et ses écoles doctorales, l’UPVD est particulièrement impliquée dans les enjeux sociétaux actuels, notamment la transition écologique, la biodiversité et l’adaptation des plantes aux changements climatiques. Ses axes de recherche couvrent également les sciences et techniques, les lettres et sciences humaines, le droit, les sciences économiques et le management. L’UPVD dispose également d’une Fondation Universitaire.

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Le Projet

Les écosystèmes récifaux sont gravement menacés par les effets du changement climatique mondial. Les coraux, en tant qu’organismes longévifs, voient leur capacité d’adaptation génétique dépassée par le rythme actuel des changements environnementaux. Face à cette urgence, les mécanismes d’adaptation non génétiques, tels que les mécanismes épigénétiques, la plasticité phénotypique et les modifications des communautés et activités microbiennes, sont de plus en plus étudiés dans le cadre de la conservation adaptative des récifs.

Les coraux constructeurs de récifs sont des holobiontes, c’est-à-dire qu’ils s’associent à des algues intracellulaires (Symbiodiniaceae), des bactéries, des archées, des champignons et des virus. Bien que la symbiose corail-algues, qui constitue la base fonctionnelle de la formation des récifs coralliens, soit bien comprise, le rôle des autres microbes de l’holobionte reste encore largement méconnu. Ces dernières années, l’écologie des récifs coralliens a élargi son champ d’étude pour inclure le rôle potentiel de ces autres membres microbiens dans la santé, la résilience et l’acclimatation de l’holobionte corallien.

Malgré une bonne compréhension de la dynamique des communautés bactériennes associées aux coraux et de leurs réponses aux changements environnementaux, les interactions moléculaires et métaboliques des bactéries de l’holobionte corallien restent mal comprises. Les données expérimentales sur les modes de vie mutualistes des bactéries chez les coraux sont encore insuffisantes.

Le projet « Jeune Chercheur » (JCJC) « Comprendre le dialogue moléculaire entre les Endozoicomonas dans l’holobionte cnidaire » (CECIL), financé par l’ANR, vise à étudier ces interactions cruciales pour la santé des récifs coralliens.

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Missions principales

Sous la supervision de Claudia Pogoreutz (CRIOBE – UPVD), l’ingénieur·e d’études aura pour missions :

1. Maintenir des cultures d’organismes marins, notamment des dinoflagellés, des bactéries et des anémones de mer.
2. Réaliser des travaux pratiques de microbiologie :
   • Mise en œuvre de protocoles de culture axénique.
   • Isolement microbien.
   • Préparation de milieux de culture.
   • Réalisation de tests phénotypiques.
3. Effectuer des travaux de biologie moléculaire :
   • Extractions d’acides nucléiques.
   • Extraction de métabolites.
   • Assistance à l’analyse par LC-MS.
4. Soutenir les expériences sur les anémones de mer et les microorganismes :
   • Co-cultures.
   • Manipulation du microbiome.

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Profil recherché

Formation et compétences :

• Diplôme d’ingénieur ou master en (micro)biologie, biologie moléculaire ou domaine connexe.
• Compétences obligatoires :
  • Maîtrise des techniques de laboratoire en microbiologie (cultures axéniques, isolement microbien).
  • Connaissances de base en biologie moléculaire (extraction d’acides nucléiques, électrophorèse sur gel, (q)PCR).
• Compétences appréciées :
  • Expérience en préparation d’échantillons pour l’analyse métabolomique et protéomique, ou motivation pour acquérir ces compétences.
  • Solides compétences organisationnelles.
• Langues :
  • Anglais obligatoire (langue de travail).
  • Français souhaité.

Environnement de travail :

• Collaboration avec des stagiaires, des post-doctorant·e·s et des partenaires internationaux.
• Travail au sein du CRIOBE (UPVD) et utilisation des plateformes BioEnvironnement (UPVD) et Bio2Mar (métabolomique).

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Conditions

• Salaire : 1 964 € brut/mois (Indice Majoré 395 – IGE contractuel·le).
• Avantages :
  • Intégration dans un laboratoire dynamique et pluridisciplinaire.
  • Participation à un projet innovant et d’envergure internationale.

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Candidature

Dossier à envoyer avant le 19/12/2025 :

• CV détaillé.
• Lettre de motivation.

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Mots-clés

#BiologieMoléculaire #Microbiologie #Holobionte #Coraux #Symbiose #ANR #CECIL #CRIOBE #UPVD #Perpignan #ÉcologieMarine #ChangementClimatique #LCMS #Métabolomique #PosteIngénieur